工具
开源科研软件、预训练模型与在线资源。
科研软件
这里汇集了我在蛋白质与 RNA 生物信息学研究中开发或维护的部分开源工具、预训练模型和在线资源。
ProtFlash
采用线性复杂度注意力机制的轻量级蛋白质语言模型，用于高效蛋白质表征学习。
NeuroPred-PLM
基于蛋白质语言模型的可解释神经肽预测方法。
DeepNeuropePred
结合蛋白质语言模型与卷积网络，稳健预测神经肽前体的切割位点。
LocPred-Prok
结合双分支网络与蛋白质语言模型的原核蛋白亚细胞定位预测方法。
MetaFold-RNA
利用元学习引导深度网络实现准确 RNA 二级结构预测的方法。
SSAlign
融合序列与结构表征的高效、高灵敏度蛋白质结构检索方法。